در حال حاضر اين پژوهشکده دارای 90نفر كارمند با 20عضو هيات علمي (7 استاديار و 13مربي)، 6محقق و 9كارشناس است كه در پنج بخش تحقيقاتي شامل اصلاح و تهیه نهال و بذر، گیاهپزشکی، فني و مهندسي، خاك و آب، خدمات فنی و تحقيقاتي مشغول پژوهش هستند و دارای 2 ایستگاه تحقیقاتی شهید یاسینی كترا و خرم آباد تنکابن و همچنین 8 ایستگاه همکار در اجرای پروژه های تحقیقاتی در استان های مرکبات خیز کشور از جمله آستارا، بهشهر و بايعكلا (در شمال ایران)، جیرفت، داراب، میناب، حاجیآباد، صفیآباد و شلدان و باهوكلات (در جنوب ایران)است. باغ مادري يا بانك ژن مركبات در سه مكان شامل ایستگاههاي تحقیقاتی كترا، جهرم و دزفول تاسیس شده است كه به ترتيب داراي 135، 195 و 70 بيوتيپ مركبات هستند.